La Auditoría Interna en el Gobierno de Chile, surge en forma coordinada, mediante Instructivo Presidencial del año 1994, como una unidad asesora de los niveles máximos de la organización, dedicada a proteger los intereses públicos, mediante la instalación y/o fortalecimiento de los sistemas de control interno institucionales.

“El control interno gubernamental es un sistema coordinado y coherente de la administración propio del Ejecutivo, diseñado principalmente como apoyo a la gestión pública. Sin perjuicio de lo anterior, está el control externo, que de acuerdo con el ordenamiento jurídico le corresponde ejercer a la Contraloría General de la República “ (Documento Técnico N° 5, CAIGG)